蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展

王科云 叶明亮 邹汉法

引用本文: 王科云,  叶明亮,  邹汉法. 蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展[J]. 色谱, 2016, 34(12): 1161-1167. doi: 10.3724/SP.J.1123.2016.08023 shu
Citation:  WANG Keyun,  YE Mingliang,  ZOU Hanfa. Recent advances in proteomic analysis of protein methylation[J]. Chinese Journal of Chromatography, 2016, 34(12): 1161-1167. doi: 10.3724/SP.J.1123.2016.08023 shu

蛋白质甲基化修饰的蛋白质组学分析方法新进展

  • 基金项目:

    基金委杰出青-基金(21525524);国家重点研发计划(2016YFA0501402).

摘要: 蛋白质的甲基化修饰是一类重要的翻译后修饰。但与磷酸化、糖基化和泛素化等翻译后修饰相比,甲基化修饰的蛋白质组学分析方法开发还是一个较新的研究领域。近几年,由于甲基化修饰在表观遗传调控中的重要作用,这一修饰类型得到了越来越多的关注,相关的分析技术和分析方法也取得了较多进展。其中,基于质谱的蛋白质组学分析方法在甲基化修饰中发挥着关键的作用,实现了这一甲基化修饰的高通量分析。该综述将从甲基化修饰的分离富集、假阳性率控制以及定量蛋白质组学等方面对一些蛋白质甲基化修饰的分析技术和方法的最新进展进行介绍。

English

    1. [1] Fontecave M, Atta M, Mulliez E. Trends Biochem Sci, 2004, 29(5):243

    2. [2] Walsh C T, Garneau-Tsodikova S, Gatto G J Jr. Angew Chem Int Ed Engl, 2005, 44(45):7342

    3. [3] Afjehi-Sadat L, Garcia B A. Curr Opin Chem Biol, 2013, 17(1):12

    4. [4] Bedford M T, Richard S. Mol Cell, 2005, 18(3):263

    5. [5] Martin C, Zhang Y. Nat Rev Mol Cell Bio, 2005, 6(11):838

    6. [6] Stallcup M R. Oncogene, 2001, 20(24):3014

    7. [7] Klose R J, Zhang Y. Nat Rev Mol Cell Biol, 2007, 8(4):307

    8. [8] Shi Y, Whetstine J R. Mol Cell, 2007, 25(1):1

    9. [9] Clarke S G. Trends Biochem Sci, 2013, 38(5):243

    10. [10] van Nuland R, Gozani O. Mol Cell Proteomics, 2016, 15(3):755

    11. [11] Rivera C, Gurard-Levin Z A, Almouzni G, et al. Biochim Biophys Acta, 2014, 1839(12):1433

    12. [12] Black J C, Van Rechem C, Whetstine J R. Mol Cell, 2012, 48(4):491

    13. [13] Grillo M A, Colombatto S. Amino Acids, 2005, 28(4):357

    14. [14] Polevoda B, Sherman F. Mol Microbiol, 2007, 65(3):590

    15. [15] Carlson S M, Gozani O. J Mol Biol, 2014, 426(20):3350

    16. [16] Zhang Y, Fonslow B R, Shan B, et al. Chem Rev, 2013, 113(4):2343

    17. [17] Ong S-E, Mittler G, Mann M. Nat Methods, 2004, 1(2):119

    18. [18] Scholz C, Weinert B T, Wagner S A, et al. Nat Biotechnol, 2015, 33(4):415

    19. [19] Chen Y, Zhao W, Yang J S, et al. Mol Cell Proteomics, 2012, 11(10):1048

    20. [20] Udeshi N D, Svinkina T, Mertins P, et al. Mol Cell Proteomics, 2013, 12(3):825

    21. [21] Wagner S A, Beli P, Weinert B T, et al. Mol Cell Proteomics, 2011, 10(10):M111.013284

    22. [22] Carlson S M, Moore K E, Green E M, et al. Nat Protoc, 2014, 9(1):37

    23. [23] Moore K E, Carlson S M, Camp N D, et al. Mol Cell, 2013, 50(3):444

    24. [24] Guo A, Gu H, Zhou J, et al. Mol Cell Proteomics, 2014, 13(1):372

    25. [25] Geoghegan V, Guo A, Trudgian D, et al. Nat Commun, 2015, 6:6758

    26. [26] Sylvestersen K B, Horn H, Jungmichel S, et al. Mol Cell Proteomics, 2014, 13(8):2072

    27. [27] Cao X J, Arnaudo A M, Garcia B A. Epigenetics, 2013, 8(5):477

    28. [28] Olsen J B, Cao X J, Han B, et al. Mol Cell Proteomics, 2016, 15(3):892

    29. [29] Wu Z, Cheng Z, Sun M, et al. Mol Cell Proteomics, 2015, 14(2):329

    30. [30] Liu H, Galka M, Mori E, et al. Mol Cell, 2013, 50(5):723

    31. [31] Uhlmann T, Geoghegan V L, Thomas B, et al. Mol Cell Proteomics, 2012, 11(11):1489

    32. [32] Islam K, Bothwell I, Chen Y, et al. J Am Chem Soc, 2012, 134(13):5909

    33. [33] Wang R, Zheng W, Yu H, et al. J Am Chem Soc, 2011, 133(20):7648

    34. [34] Patterson D M, Nazarova L A, Prescher J A. Acs Chem Biol, 2014, 9(3):592

    35. [35] Zhang Y, Pan Y, Liu W, et al. Chem Commun (Camb), 2016, 52(40):6689

    36. [36] Finkelstein J D. J Nutr Biochem, 1990, 1(5):228

    37. [37] Wang K, Zhou Y J, Liu H, et al. J Proteomics, 2015, 114:226

    38. [38] Tsukada Y, Fang J, Erdjument-Bromage H, et al. Nature, 2006, 439(7078):811

    39. [39] Picotti P, Aebersold R. Nat Methods, 2012, 9(6):555

  • 加载中
计量
  • PDF下载量:  22
  • 文章访问数:  1272
  • HTML全文浏览量:  572
文章相关
  • 收稿日期:  2016-08-22
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

  1. 本站搜索
  2. 百度学术搜索
  3. 万方数据库搜索
  4. CNKI搜索

/

返回文章