特异性检测珍珠龙胆石斑鱼虹彩病毒病的核酸适配体的筛选与鉴定

余庆 刘明珠 肖贺贺 易弋 程昊 Putra Dedi-Fazriansyah 黎思巧 李鹏飞

引用本文: 余庆,  刘明珠,  肖贺贺,  易弋,  程昊,  Putra Dedi-Fazriansyah,  黎思巧,  李鹏飞. 特异性检测珍珠龙胆石斑鱼虹彩病毒病的核酸适配体的筛选与鉴定[J]. 分析化学, 2020, 48(5): 650-661. doi: 10.19756/j.issn.0253-3820.191647 shu
Citation:  YU Qing,  LIU Ming-Zhu,  XIAO He-He,  YI Yi,  CHENG Hao,  Putra Dedi-Fazriansyah,  LI Si-Qiao,  LI Peng-Fei. Selection and Characterization of Aptamers for Specific Detection of Iridovirus Disease in Cultured Hybrid Grouper (Epinephelus Fuscoguttatus ♀×E. Lanceolatus ♂)[J]. Chinese Journal of Analytical Chemistry, 2020, 48(5): 650-661. doi: 10.19756/j.issn.0253-3820.191647 shu

特异性检测珍珠龙胆石斑鱼虹彩病毒病的核酸适配体的筛选与鉴定

  • 基金项目:

    本文系国家自然科学基金项目(Nos.41706145,41966004)、广西重点研发计划项目(No.2018AB52003)、广西自然科学基金项目(Nos.2019GXNSFAA245054,AD19245022)和广西科学院基本科研业务费项目(Nos.2019YJJ1005,2018YJJ903,2018YJJ902)资助

摘要: 石斑鱼虹彩病毒是一种核质DNA病毒,不仅给海水养殖造成巨大的经济损失,而且严重威胁全球生物多样性。为了进一步阐明石斑鱼虹彩病毒侵染致病的分子机理,同时为石斑鱼虹彩病毒病的预防、诊断和治疗提供新的理论依据,本研究以珍珠龙胆石斑鱼虹彩病毒(SGIV-Gx)感染的宿主细胞为靶标,采用指数富集配体系统进化技术(SELEX)筛选获得4条核酸适配体(LYGV1、LYGV2、LYGV3、LYGV4),并对核酸适配体的性质进行了系统的分析研究。各条核酸适配体识别SGIV-Gx病毒感染的宿主细胞具有高特异性和高亲和性,筛选的核酸适配体无毒副作用,而且核酸适配体LYGV3具有一定的抗病毒效果。对核酸适配体的靶标性质进行了分析,结果表明,核酸适配体(LYGV1、LYGV2、LYGV3、LYGV4)的靶标可能是细胞膜蛋白或膜蛋白相关成分。其中,核酸适配体LYGV1的靶位点在SGIV-Gx病毒感染细胞2 h后出现在宿主细胞表面,核酸适配体LYGV2、LYGV3和LYGV4的靶位点的出现时间分别为病毒感染细胞后的4、8和6 h。

English


    1. [1]

      LI Peng-Fei, YU Qing, LUO Yong-Ju, QIN Qi-Wei, LIU Ming-Zhu, XIAO Jun, NIE Zhen-Ping. Journal of Guangxi Academy of Sciences,2019,35(3): 161-165 李鹏飞, 余 庆, 罗永巨, 秦启伟, 刘明珠, 肖 俊, 聂振平.广西科学院学报,2019, 35(3): 161-165

    2. [2]

      ZHANG Xian-Liang, CUI Li-Feng, LI Shu-Min, LIU Xin-Zhong. HAN Xu, JIANG Kai-Yong, YU Xiu-Juan. China Fishery Statistics Yearbook, Beijing: China Agricultural Press, 2019:22 张显良, 崔利锋, 李书民, 刘新中, 韩 旭, 江开勇, 于秀娟.中国渔业统计年鉴. 北京: 中国农业出版社, 2019:22[LM]

    3. [3]

      Yu Q, Liu M, Xiao H, Wu S, Qin X, Lu Z, Shi D, Li S, Mi H, Wang Y, Su H, Wang T, Li P. J. Fish Dis., 2019, 42(6): 859-868

    4. [4]

      Yuan Y, Wang Y, Liu Q, Zhu F, Hong Y. Sci. Rep., 2016, 6: 31170

    5. [5]

      Qin Q W, Chang S F, Ngoh-Lim G H, Gibson-Kueh S, Shi C, Lam T J. Dis. Aquat. Organ., 2003, 53(1): 1-9

    6. [6]

      Wang S, Huang X, Huang Y, Hao X, Xu H, Cai M, Wang H, Qin Q. J. Virol., 2014, 88(22): 13047-13063

    7. [7]

      Li P, Zhou L, Wei J, Yu Y, Yang M, Wei S, Qin Q. J. Appl. Microbiol., 2016, 121(3): 634-643

    8. [8]

      Qin Q, Gin K, Lee L, Gedaria A I, Zhang S. J. Virol. Methods, 2005, 125(1): 49-54

    9. [9]

      Ellington A D, Szostak J W. Nature, 1990, 346: 818-822

    10. [10]

      ZOU Xue-Mei, ZHOU Jia-Wei, SONG Shang-Hong, CHEN Guan-Hua. Chinese J. Anal. Chem., 2019, 47(4): 488-499 邹雪梅, 周佳伟, 宋尚红, 陈冠华.分析化学, 2019, 47(4): 488-499

    11. [11]

      Duclair S, Gautam A, Ellington A, Prasad V R. Mol. Ther. Nucleic Acids, 2015, 4: e228

    12. [12]

      Li P, Yan Y, Wei S, Wei J, Gao R, Huang X, Huang Y, Jiang G, Qin Q. Virus Res., 2014, 188: 146-154

    13. [13]

      Yu Q, Liu M, Su H, Xiao H, Wu S, Qin X, Li S, Mi H, Lu Z, Shi D, Li P. J. Fish Dis., 2019, 42(6): 851-858

    14. [14]

      Zhou J, Rossi J J. BioDrugs, 2012, 26(6): 393-400

    15. [15]

      Duan N, Wu S, Dai S, Gu H, Hao L, Ye H, Wang Z. Analyst, 2016, 141(13): 3942-3961

    16. [16]

      Zhou L, Li P, Ni S, Yu Y, Yang M, Wei S, Qin Q. J. Fish Dis., 2017, 40(12): 1831-1838

    17. [17]

      Gao Y, Yu X, Xue B, Zhou F, Wang X, Yang D, Liu N, Xu L, Fang X, Zhu H. PLoS One, 2014, 9(2): e90333

    18. [18]

      Yu Q, Liu M, Wei S, Xiao H, Wu S, Qin X, Shi D, Li S, Wang T, Li P. Fish. Pathol., 2019, 54(1): 16-19

    19. [19]

      Xiao H, Liu M, Li S, Shi D, Zhu D, Ke K, Xu Y, Dong D, Zhu L, Yu Q, Li P. J. Aquat. Anim. Health, 2019, 31(4): 364-370

    20. [20]

      Yu Q, Liu M, Wei S, Wu S, Xiao H, Qin X, Su H, Li P. J. Gen. Virol., 2019, 100(3): 380-391

    21. [21]

      Li P, Wei S, Zhou L, Yang M, Yu Y, Wei J, Jiang G, Qin Q. J. Gen. Virol., 2015, 96: 3348-3359

    22. [22]

      Liang H R, Hu G Q, Zhang T, Yang Y J, Zhao L L, Qi Y L, Wang H L, Gao Y W, Yang S T, Xia X Z. Int. Immunopharmacol., 2012, 14(3): 341-347

    23. [23]

      Tang Z, Parekh P, Turner P, Moyer R W, Tan W. Clin. Chem., 2009, 55(4): 813-822

    24. [24]

      Bai C, Lu Z, Jiang H, Yang Z, Liu X, Ding H, Li H, Dong J, Huang A, Fang T, Jiang Y, Zhu L, Lou X, Li S, Shao N. Biosens. Bioelectron., 2018, 110: 162-167

    25. [25]

      Lu T, Ma Q, Yan W, Wang Y, Zhang Y, Zhao L, Chen H. Talanta, 2018, 176: 214-220

    26. [26]

      Li P, Zhou L, Yu Y, Yang M, Ni S, Wei S, Qin Q. BMC Vet. Res., 2015, 11: 245

    27. [27]

      Hwang S D, Midorikawa N, Punnarak P, Kikuchi Y, Kondo H, Hirono I, Aoki T. J. Fish Dis., 2012, 35(12): 927-934

    28. [28]

      Zhou L, Li P, Yang M, Yu Y, Huang Y, Wei J, Wei S, Qin Q. Antiviral. Res., 2016, 129: 104-114

    29. [29]

      Tang X, Zheng J, Yan Q, Li Z, Li Y. Biotechnol. Lett., 2013, 35(6): 909-914

    30. [30]

      Duan N, Wu S, Yu Y, Ma X, Xia Y, Chen X, Huang Y, Wang Z. Anal. Chim. Acta, 2013, 804: 151-158

    31. [31]

      Li P, Yu Q, Zhou L, Dong D, Wei S, Ya H, Chen B, Qin Q. Virus. Res., 2018, 246: 46-54

    32. [32]

      WANG Wei, JIA Ling-Yun. Chinese J. Anal. Chem., 2009, 37(3): 454-460 王 巍, 贾凌云.分析化学,2009, 37(3): 454-460

    33. [33]

      WANG Yong, ZHAO Xin-Ying, SHI Dong-Dong, YANG Ge, QU Feng. Chinese Journal of Chromatography, 2016, 34(4): 361-369 王 勇, 赵新颖, 石冬冬, 杨 歌, 屈 锋.色谱, 2016, 34(4): 361-369

    34. [34]

      LIU Pin-Duo, QU Feng. Chinese Journal of Chromatography, 2016, 34(4): 382-388 刘品多, 屈 锋.色谱, 2016, 34(4): 382-388

    35. [35]

      Shangguan D H, Meng L, Cao Z C, Xiao Z, Fang X, Li Y, Cardona D, Witek R P, Liu C, Tan W H. Anal. Chem., 2008, 80(3): 721-728

    36. [36]

      Jin C, Qiu L, Li J, Fu T, Zhang X, Tan W. Analyst, 2016, 141(2): 461-466

    37. [37]

      Van S, Turek D, Champanhac C, Vaizer J, Sefah K, Zhen J, Sutphen R, Tan W. Anal. Chem., 2014, 86(9): 4521-4527

    38. [38]

      Yu Q, Liu M, Wei S, Xiao H, Wu S, Ke K, Huang X, Qin Q, Li P. Front. Microbiol., 2019, 10: 2684

    39. [39]

      Simaeys D V, Turek D, Champanhac C, Vaizer J, Sefah K, Zheng J, Sutphen R, Tan W H. Anal. Chem., 2014, 86(9): 4521-4527

    40. [40]

      Porntep P, Mudjekeewis D S, Seong D H, Hidehiro K, Ikuo H, Yo K, Takashi A. Mar. Biotechnol., 2012, 14: 752-761

    41. [41]

      Jeon S H, Kayhan B, Ben-Yedidia T, Arnon R. J. Biol. Chem., 2004, 279: 48410-48419

  • 加载中
计量
  • PDF下载量:  0
  • 文章访问数:  26
  • HTML全文浏览量:  0
文章相关
  • 收稿日期:  2019-11-03
  • 修回日期:  2020-02-09
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
  • 1. 

    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

  1. 本站搜索
  2. 百度学术搜索
  3. 万方数据库搜索
  4. CNKI搜索

/

返回文章